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一篇2区的基因家族分析文章带你飞
1、Motif分析和系统发育分析 为了阐明BZR家族的进化关系,作者基于来自甜菜、拟南芥、水稻和大***的41个BZR家族成员的氨基酸序列构建了系统发育树,并进行了motif分析。
2、基因家族的基因在物种之间都是比较保守的,通过基因家族分析可以得到某物种特有的家族基因,而这些基因则有可能与该物种的特异性有关。
3、流程如下:最终生成NBS-ARC_qua.aln和NBS-ARC_qua.aln文件,其中NB.aln文件就是用于构建新的马尔科夫模型文件。在利用新生成的拟南芥特异的马尔科夫模型寻找pep文件中的NB-ARC基因家族序列。
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